UC 0097 หนึ่งปีหลังจากการเปิด “Laplace’s Box” แม้จะมีการเปิดเผยกฎบัตรศตวรรษสากลที่ยอมรับการมีอยู่และสิทธิของนิวไทป์ แต่กรอบการทำงานของโลกก็ไม่ได้เปลี่ยนแปลงไปมากนัก ความขัดแย้งที่ถูกขนานนามว่า “เหตุการณ์ลาปลาซ” ในเวลาต่อมา คาดว่าจะจบลงด้วยการล่มสลายของพวกซีออนนีโอที่รู้จักกันในชื่อแขนเสื้อ ในการต่อสู้ครั้งสุดท้าย โมบิลสูทแบบเต็มไซโคเฟรมสองชุดแสดงพลังเหนือความเข้าใจของมนุษย์ ยูนิคอร์นสีขาวและสิงโตดำถูกปิดผนึกไว้เพื่อขจัดอันตรายนี้ออกจากจิตสำนึกของผู้คน และตอนนี้พวกเขาควรจะลืมไปโดยสิ้นเชิง อย่างไรก็ตาม RX-0 Unicorn Gundam 03 ซึ่งหายไปเมื่อสองปีก่อน กำลังจะปรากฏตัวใน Earth Sphere อีกครั้ง ฟีนิกซ์สีทอง… ชื่อฟีนิกซ์